Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK2P49760 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK2P49760 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK2P49760 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK2P49760 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK2P49760 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK2P49760 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK2P49760 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK2P49760 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLK2P49760 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLK2P49760 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK2P49760 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK2P49760 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK2P49760 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK2P49760 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK2P49760 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK2P49760 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK2P49760 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK2P49760 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK2P49760 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK2P49760 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK2P49760 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK2P49760 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK2P49760 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK2P49760 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK2P49760 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK2P49760 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK2P49760 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK2P49760 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK2P49760 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK2P49760 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK2P49760 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK2P49760 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK2P49760 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK2P49760 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK2P49760 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK2P49760 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK2P49760 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK2P49760 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLK2P49760 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLK2P49760 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLK2P49760 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLK2P49760 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLK2P49760 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK2P49760 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK2P49760 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK2P49760 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK2P49760 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK2P49760 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK2P49760 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK2P49760 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK2P49760 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK2P49760 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK2P49760 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK2P49760 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms