Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX5P48382 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX5P48382 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX5P48382 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX5P48382 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX5P48382 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX5P48382 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RFX5P48382 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFX5P48382 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX5P48382 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX5P48382 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX5P48382 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX5P48382 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX5P48382 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX5P48382 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX5P48382 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX5P48382 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFX5P48382 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFX5P48382 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RFX5P48382 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RFX5P48382 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFX5P48382 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RFX5P48382 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFX5P48382 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RFX5P48382 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFX5P48382 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFX5P48382 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX5P48382 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX5P48382 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX5P48382 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX5P48382 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX5P48382 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX5P48382 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFX5P48382 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX5P48382 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX5P48382 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX5P48382 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX5P48382 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX5P48382 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX5P48382 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX5P48382 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX5P48382 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX5P48382 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX5P48382 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFX5P48382 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX5P48382 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX5P48382 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX5P48382 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX5P48382 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX5P48382 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFX5P48382 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RFX5P48382 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFX5P48382 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFX5P48382 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFX5P48382 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFX5P48382 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFX5P48382 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RFX5P48382 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX5P48382 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX5P48382 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX5P48382 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX5P48382 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX5P48382 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX5P48382 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX5P48382 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX5P48382 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX5P48382 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RFX5P48382 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFX5P48382 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms