Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA3P43357 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA3P43357 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms