Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnd3P30282 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccnd3P30282 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms