Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUSP1P28562 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms