Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTPS1P17812 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTPS1P17812 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms