Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RLBP1P12271 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms