Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF1P10914 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF1P10914 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF1P10914 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF1P10914 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF1P10914 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF1P10914 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF1P10914 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF1P10914 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF1P10914 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF1P10914 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF1P10914 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF1P10914 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF1P10914 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF1P10914 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF1P10914 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF1P10914 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF1P10914 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF1P10914 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF1P10914 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF1P10914 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF1P10914 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF1P10914 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF1P10914 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF1P10914 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms