Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igsf6P0C6B7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igsf6P0C6B7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igsf6P0C6B7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igsf6P0C6B7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igsf6P0C6B7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms