Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSF1RP07333 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CSF1RP07333 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms