Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOA4P06727 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOA4P06727 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOA4P06727 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA4P06727 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA4P06727 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA4P06727 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA4P06727 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA4P06727 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA4P06727 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOA4P06727 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOA4P06727 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA4P06727 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA4P06727 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA4P06727 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA4P06727 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA4P06727 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA4P06727 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA4P06727 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA4P06727 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA4P06727 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOA4P06727 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA4P06727 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA4P06727 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA4P06727 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA4P06727 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA4P06727 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA4P06727 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA4P06727 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA4P06727 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA4P06727 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA4P06727 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOA4P06727 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA4P06727 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA4P06727 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA4P06727 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA4P06727 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA4P06727 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA4P06727 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA4P06727 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA4P06727 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA4P06727 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA4P06727 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOA4P06727 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOA4P06727 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA4P06727 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms