Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms