Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LatO54957 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LatO54957 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LatO54957 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LatO54957 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LatO54957 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LatO54957 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LatO54957 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LatO54957 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LatO54957 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LatO54957 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LatO54957 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LatO54957 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LatO54957 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LatO54957 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LatO54957 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LatO54957 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LatO54957 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LatO54957 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LatO54957 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LatO54957 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LatO54957 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LatO54957 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LatO54957 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LatO54957 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LatO54957 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LatO54957 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LatO54957 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LatO54957 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms