Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2AO43633 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2AO43633 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms