Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRS3O43559 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRS3O43559 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRS3O43559 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRS3O43559 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRS3O43559 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FRS3O43559 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRS3O43559 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FRS3O43559 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRS3O43559 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRS3O43559 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRS3O43559 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRS3O43559 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRS3O43559 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRS3O43559 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRS3O43559 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRS3O43559 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRS3O43559 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRS3O43559 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRS3O43559 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRS3O43559 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FRS3O43559 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRS3O43559 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRS3O43559 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRS3O43559 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRS3O43559 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRS3O43559 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRS3O43559 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRS3O43559 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRS3O43559 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRS3O43559 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRS3O43559 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRS3O43559 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRS3O43559 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRS3O43559 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FRS3O43559 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRS3O43559 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRS3O43559 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRS3O43559 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FRS3O43559 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRS3O43559 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRS3O43559 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRS3O43559 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRS3O43559 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRS3O43559 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms