Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sp100O35892 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Sp100O35892 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sp100O35892 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sp100O35892 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sp100O35892 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sp100O35892 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sp100O35892 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sp100O35892 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Sp100O35892 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Sp100O35892 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Sp100O35892 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sp100O35892 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Sp100O35892 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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