Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBXN8O00124 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN8O00124 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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