Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms