Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vmn1r76F8VQ63 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r76F8VQ63 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.2 ms