Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf212F6TQD1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf212F6TQD1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf212F6TQD1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf212F6TQD1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf212F6TQD1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf212F6TQD1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf212F6TQD1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf212F6TQD1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf212F6TQD1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf212F6TQD1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf212F6TQD1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf212F6TQD1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf212F6TQD1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf212F6TQD1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf212F6TQD1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf212F6TQD1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Rnf212F6TQD1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rnf212F6TQD1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rnf212F6TQD1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rnf212F6TQD1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rnf212F6TQD1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rnf212F6TQD1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rnf212F6TQD1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rnf212F6TQD1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rnf212F6TQD1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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