Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930579F01RikE9Q3L6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms