Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Fndc1E9Q043 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Fndc1E9Q043 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms