Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO5BA8MYB1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMCO5BA8MYB1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms