Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MED23Q9ULK4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MED23Q9ULK4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms