Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma4Q9R1P0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms