Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBNL3Q9NUK0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBNL3Q9NUK0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms