Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVK-5Q9HDB9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms