Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1Q9H7V2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms