Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSER2Q9H7U1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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