Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MsraQ9D6Y7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MsraQ9D6Y7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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