Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTRAFQ9CQE8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTRAFQ9CQE8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms