Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap3bQ9CQE1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms