Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab5aQ9CQD1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab5aQ9CQD1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms