Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms