Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTNAP4Q9C0A0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP4Q9C0A0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP4Q9C0A0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms