Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms