Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gins4Q99LZ3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gins4Q99LZ3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms