Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ROBO3Q96MS0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROBO3Q96MS0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROBO3Q96MS0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROBO3Q96MS0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms