Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP36Q96EU6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP36Q96EU6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms