Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC10A4Q96EP9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms