Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG4AQ8WYN0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4AQ8WYN0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms