Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms