Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERC6Q8IVU3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERC6Q8IVU3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms