Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nrip1Q8CBD1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms