Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms