Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CYHR1Q6ZMK1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYHR1Q6ZMK1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms