Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASC1Q6TDU7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms