Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZBED9Q6R2W3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms