Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox19Q62249 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox19Q62249 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms