Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms