Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc42Q5SV66 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms